Term:PAM

PAM är en förkortning av engelskans protospacer adjecent motif och är en 3 baspar lång DNA-sekvens som känns igen av endonukleaset Cas9 (enzym som är en del av gensaxen CRISPR/Cas9).

PAM-sekvensen skrivs ibland ut som “NGG” vilket indikerar att den kan börja med vilken bas som helst (A, T, G, C) men slutar med GG. Olika endonukleaser har olika PAM-sekvenser.

Mer information finns på faktasidan Gensaxen CRISPR/Cas9.

illustration av hur CRISPR/Cas9 fungerar
I gensaxen CRISPR/Cas9 känner endonukleaset Cas9 igen ett PAM motiv och vid ett sådant upp DNA-strängarna. Det guide-RNA som Cas9 har med sig försöker baspara med sekvensen vid PAM och lyckas det så klyver Cas9 den dubble DNA-strängen. Illustration Gunilla Elam.